地黄饮子对APP/PS1双转基因小鼠肠道菌群的影响

目的 采用16S rRNA测序技术,检测地黄饮子对5月龄APP/PS1双转基因小鼠肠道菌群多样性、相对丰度等差异.方法 将转基因APP/PS1(-)小鼠设为正常组,其余转基因阳性APP/PS1(+)分为模型组、中药组和西药组.中药组灌胃给予地黄饮子24g·kg-1,西药组灌胃给予安理申0.8mg·kg-1,正常组ig给予同等体积的生理盐水,1次/d,连续28 d.提取试剂盒抽提各组粪便样本中DNA,对V3-V4区进行PCR扩增,再使用Illumina Miseq PE300高通量测序平台进行Paired-end测序.最后对数据进行生物信息学分析,结果 本研究共得到1003个OTUs.物种累积曲线表明本研究所收集的样本量充足.Alpha多样性分析,中药组与其余组相比显著提高了菌群的多样性,Beta多样性分析,各组数据组间差异明显,物种韦恩图显示,中药组和西药组均能降低APP模型小鼠的微生物菌群OTU丰度,但较正常组增加了OTU丰度.菌种分类水平提示地黄饮子更倾向提升菌群的多样性,尤其是在厚壁菌门的菌种,优势菌种的比例更接近正常组;LEfSe分析中药组的优势菌群是梭菌纲o_Clostridia_vadinBB60_group,疣微菌g_UCG_005.结论 地黄饮子可能通过肠道菌群改变菌群差异性和多样性,提高厚壁菌门、芽孢杆菌属、乳杆菌属、毛螺旋菌属等菌种丰度,以肠脑轴的方式改善AD的认知症状.