清远麻鸡线粒体DNA细胞色素b基因遗传多样性分析

为了更好地对清远麻鸡种质资源进行保护和开发利用,以线粒体DNA(mtDNA)细胞色素b(cytochrome b,Cytb)基因为分子标记,检测了 80只清远麻鸡的遗传多样性,并探讨了清远麻鸡在5个红色原鸡亚种的进化地位.结果显示:清远麻鸡mtDNA Cytb基因序列全长为1 143 bp,碱基T、C、A和G的平均比例分别是24.08％、36.38％、27.46％和12.08％.单倍型多样性(Hd)为0.585±0.038,核苷酸多样性(Pi)为0.000 87±0.000 59,平均核苷酸差异(K)为0.995.80条序列共发现13个多态位点,其中11个为单变异位点,2个为简约信息位点;基于多态位点定义了 7种单倍型,系统发育树显示清远麻鸡与红色原鸡既有独立分支,又有相互交叉.清远麻鸡在mtDNA水平上呈中度遗传多样性,研究结果为清远麻鸡种质资源遗传评估、有效保种和选育利用提供了理论依据.