2020—2022年华中地区犬副流感病毒检测及其F、HN基因系统发育分析

为探究华中地区犬副流感病毒(CPIV)的流行及遗传进化情况,利用RT-PCR方法对华中地区2020年9月—2022年1月收集的418份病料样品进行了CPIV检测,并利用生物信息学软件对分离的CPIV毒株的F、HN基因进行同源性、氨基酸位点分析及系统发育分析.结果显示:CPIV阳性率为15.8％,扩增获得9株CPIV的F、HN基因的序列,并成功分离培养9株CPIV毒株;同时,将分离株的F、HN基因与19株副流感病毒参考毒株进行序列比对分析,结果表明,F基因核苷酸同源性为95.1％～100％,氨基酸同源性为94.6％～99.8％,HN基因核苷酸同源性为95.9％～99.9％,氨基酸同源性为95.8％～99.6％;CPIV的F及HN基因与参考毒株相比均有部分氨基酸发生了突变;系统发育分析结果显示,本研究获得的8株分离株与美国株CPI-和CPI+处于同一分支上,亲缘关系较近,另一株分离株CS-324与中国株HeN0718和韩国株D277位于同一分支上.本研究丰富了华中地区CPIV的流行病学调查资料,并为该病的综合防控提供了理论依据.