基于网络药理学和分子对接探究诃子鞣酸防治奶牛子宫内膜炎的作用机制

China Animal Husbandry & Veterinary Medicine(2023)

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摘要
[目的]基于网络药理学结合分子对接技术探究诃子鞣酸防治奶牛子宫内膜炎的作用,并阐明其潜在机制.[方法]通过SwissTargetPrediction和PharmMapper数据库收集和预测诃子鞣酸的作用靶点,通过UniProt数据库标准化并去重.从OMIM和DRUGBANK数据库中获取奶牛子宫内膜炎相关基因并去重,绘制Venn图获取诃子鞣酸和奶牛子宫内膜炎交集靶点.使用STRING数据库构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,使用DAVID数据库进行GO功能和KEGG通路富集分析.利用分子对接技术对KEGG通路富集分析后得到的关键通路靶点进行分子对接,以验证网络药理学分析结果的准确性.[结果]通过多个数据库检索及筛选获得诃子鞣酸潜在靶点基因333个,奶牛子宫内膜炎相关靶点基因342个,共有18个交集靶点.PPI结果显示,诃子鞣酸可能作用于前列腺素-内过氧化物酶合酶 1(prostaglandin G/H synthase 1,PTGS1)、PTGS2、花生四烯酸 12-脂氧合酶(arachidonate 12-lipoxygenase,ALOX12)、ALOX15等18个关键靶点.GO功能和KEGG通路富集分析结果显示,诃子鞣酸可通过脂氧合酶途径、花生四烯酸代谢通路、雌激素信号等通路防治奶牛子宫内膜炎.分子对接结果显示,诃子鞣酸与所得关键靶点均具有良好的结合活性,诃子鞣酸可通过多靶点发挥防治奶牛子宫内膜炎的作用,证明网络药理学预测结果准确.[结论]诃子鞣酸可能通过与PTGS1、PTGS2、ALOX12、细胞肿瘤抗原p53(cellular tumor antigen p53,TP53)结合,在脂氧合酶通路、花生四烯酸代谢过程上发挥防治奶牛子宫内膜炎的作用.
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关键词
chebulagic acid,endometritis,network pharmacology,targets,molecular docking
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