急性髓细胞白血病患者外周血ABO基因mRNA表达分析

目的 了解急性髓细胞白血病患者外周血ABO基因mRNA表达特点.方法 下载TCGA数据库急性髓细胞白血病RNAseq数据和GTEx数据库中的全血RNAseq数据.使用R软件分析急性髓细胞白血病和GTEx全血标本ABO基因mRNA表达水平的差异,分析急性髓细胞白血病ABO基因mRNA表达与DNA甲基化、免疫浸润以及预后的关系.结果 急性髓细胞白血病ABO基因mRNA表达水平(中位数:1.333,上四分位数:3.654,下四分位数:0.401)低于对照组(中位数:3.576,上四分位数:3.747,下四分位数:3.470),差异有统计学意义(P＜0.001).急性髓细胞白血病ABO基因mRNA表达水平与转录起始位点下游+82(r=-0.249,P＜0.001)、+618(r=-0.268,P＜0.001)、+1 080(r=-0.105,P＜0.001)以及+1 409位点(r=-0.210,P＜0.001)甲基化存在负相关关系,与B细胞、CD8 T细胞、细胞毒性细胞、浆细胞样树突状细胞、T细胞、T辅助细胞、中央记忆型T细胞、辅助性滤泡T细胞以及调节性T细胞的免疫浸润存在正相关关系(P＜0.001).急性髓细胞白血病ABO基因mRNA高表达患者的生存时间(中位生存时间:366 d,置信区间:304-731 d)和低表达患者的生存时间(中位生存时间:731 d,置信区间:335-1 402 d)之间的差异无统计学意义(P＞0.05).结论 急性髓细胞白血病患者外周血ABO基因mRNA表达是下降的,其与ABO基因第一内含子DNA甲基化以及免疫浸润有关,而与预后无关.