基于DNA分子标记的潘氏闭壳龟遗传多样性分析

Chinese Journal of Zoology(2023)

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摘要
潘氏闭壳龟(Cuora pani)是中国特有种,国家二级重点保护野生动物.由于非法贸易加之栖息地破坏等,其野外种群数量十分稀少.本研究旨在利用线粒体基因与核基因标记揭示潘氏闭壳龟的遗传多样性和遗传结构,以期为中国潘氏闭壳龟的种群保护和管理提供科学依据.本次共研究14只潘氏闭壳龟个体,其中,6只原产地为四川广元,8只产地未知.结果表明,在14只潘氏闭壳龟样本中鉴定出Cytb单倍型、ND4单倍型和R35单倍型各2个,且均有1个新单倍型;Cytb、ND4和R35基因单倍型多样性分别为0.440、0.143和0.154,核苷酸多样性分别为0.000 41、0.000 19和0.000 63;各单倍型的平均遗传距离(p)均小于0.01.基于三个基因联合数据集的系统发育分析表明,潘氏闭壳龟与金头闭壳龟(C.aurocapitata)互为单系进化支,且中性检测和核苷酸错配分析显示,潘氏闭壳龟群体近期历史上可能未经历群体扩张事件.潘氏闭壳龟群体遗传多样性低,种内变异小,群体应对环境变化的能力低,建议应加强对中国潘氏闭壳龟野外种群的基础研究和保护力度,同时规范人工繁殖,以避免近亲繁殖和种群衰退.
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