2021-2022年长春市水痘-带状疱疹病毒流行株基因序列的特征分析

Chinese Journal of Biologicals(2023)

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摘要
目的 对2021-2022年长春市水痘-带状疱疹病毒(varicella-zoster virus,VZV)流行株进行基因型鉴定及分子特征分析.方法 选择59例2021-2022年吉林大学中日联谊医院收治的长春市水痘或带状疱疹患者为研究对象,采用膜抗原荧光抗体(fluorescent antibody to membrane antigen,FAMA)法对患者血清中VZV特异性抗体进行鉴定.提取确诊患者疱疹液中的病毒DNA,PCR扩增VZV的多个开放阅读框(open reading frame,ORF),包括ORF1、ORF12、ORF16、ORF17、ORF21、ORF22、ORF37 和 ORF54,根据 ORF 的单核苷酸多态性(single nucleotide polymor-phism,SNP)进行基因分型.通过限制性片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)技术对多个ORF(ORF38、ORF54和ORF62)进行酶切鉴定,区分VZV临床株及疫苗株.结果 59份患者血清样本均为阳性,均确诊为VZV感染.59份疱疹液样本中,4份与Clade2基因型完全匹配;4份存在2个SNPs,分别为ORF1(SNP790)C→A突变和 ORF12(SNP18 082)T→C 突变;51 份发生 ORF12(SNP18082)T→C 突变.59株 VZV 临床株均为 Pst Ⅰ+Bgl Ⅰ+SmaⅠ-,不同于疫苗株Pst Ⅰ-Bgl Ⅰ+Sma Ⅰ+.结论 2021-2022年长春市VZV流行株均为Clade2基因型,未发现疫苗株致病情况.
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