鸡粪好氧堆肥过程中细菌群落结构和功能分析

Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology(2023)

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摘要
为了明确鸡粪好氧堆肥过程中细菌群落结构和功能的变化,采用高通量测序技术测定了好氧堆肥前、中、后3个时期样品的16S rRNA基因序列,并进行了生物信息学分析.结果表明,3个堆肥阶段中仅有10%左右的分类操作单元(operational taxonomic units,OTUs)具有阶段特异性;不同发酵阶段细菌α多样性指数ACE、Chao1和Simpson均呈现先升高后降低的趋势,但各阶段间差异不显著(P<0.05).3个发酵阶段优势菌门类相同,但丰度存在差异.线性判别分析[line discriminant analysis(LDA)effect size,LEfSe]法对细菌生物标志分析表明,从门到属水平共有49个物种,堆肥前期样品组中显著富集的物种最多,后期最少.原核分类群功能注释(functional annotation of prokaryotic taxa,FAPROTAX)对细菌功能多样性分析表明,堆肥前期细菌功能多样性最高,而随着发酵进行细菌功能富集程度增加、多样性降低.该研究为畜禽粪污好氧堆肥过程调控提供理论支撑和技术指导.
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关键词
aerobic composting,bacterial community,chicken manure,high-throughput sequencing,microbial function
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