2019—2021年深圳地区诺如病毒暴发分子流行特征

目的:了解深圳地区2019—2021年诺如病毒暴发分子流行特征。方法:收集2019年1月至2021年12月诺如病毒暴发信息及标本，应用实时荧光反转录聚合酶链式反应样本进行诺如病毒检测，阳性样本通过RT-PCR扩增、测序和序列分析；对其中3株GII.2[P16]进行基因组扩增和序列分析。结果:2019年1月至2021年12月，共报告诺如病毒暴发246起，主要发生在幼儿园（132，53.66%）和小学（52，21.14%）。每起暴发发病数范围为3~130，中位数为8。每年11月至次年3月为诺如病毒暴发的流行高峰。211起暴发分型成功，GI和GII分别检出7种和11种基因型，78起（36.97%）诺如病毒暴发由GII.2[P16]引起。对GII.2[P16]基因组分析表明，深圳2020年暴发株仍属于GII.2[P16](2016-2017)亚群，在非结构蛋白P22（L777S）和3C蛋白酶（A1047V和P1074T）上出现氨基酸变异。结论:GII.2[P16]是2019年1月至2021年12月引起深圳市诺如病毒暴发的流行株，主要发生在学校和幼儿园，持续监测和基因组分析有助于发现流行株的变异和新毒株的出现。