定量糖蛋白质组学技术对不同预后三阴性乳腺癌的研究

三阴性乳腺癌患因体内缺乏雌激素和孕激素受体同时低水平表达人表皮生长因子受体-2，常见的激素治疗和靶向治疗不敏感且预后较差。因此能够鉴别癌症不同预后的可靠生物标志物有助于评估临床治疗方案。目的：通过糖蛋白质组学方法探讨不同预后情况的三阴性乳腺癌患者糖基化修饰水平差异。方法：收集18例预后良好或预后不良的三阴性乳腺癌患者配对的癌症组织和非癌性邻近组织。使用TMT定量标记糖蛋白质组学技术和生物信息学分析方法探索不同预后三阴性乳腺癌组织之间的蛋白质糖基化修饰差异情况。结果：本研究从三阴乳腺癌组织中共鉴定出高置信度的1265种完整糖肽和146种糖蛋白质，其中63种糖蛋白被核心岩藻糖修饰。糖蛋白质组学结果显示共有25个糖蛋白仅在预后良好患者中上调，KEGG通路富集分析发其与细胞外基质-受体通路和人乳头瘤病毒感染等通路存在关联，这些信号通路与癌细胞分化以及转移关系紧密。糖蛋白CO6A6是PI3K-AKT信号通路中的重要蛋白，此通路为三阴性乳腺癌常见失调信号通路之一。此外，与非癌性邻近组织相比，糖蛋白CO6A6糖基化水平在预后良好患者癌症组织显著升高，同时在预后不良患者患者癌症组织中显著降低。其中糖基化位点N-347和N-988上的4种完整糖肽在预后良好组的癌症组织中相对丰度明显升高。糖基化位点N-347的3种完整糖肽均被核心岩藻糖修饰，且在预后良好患者癌症组织差异倍数大于1.5，说明其具有显著差异。结论：主要由核心岩藻糖修饰的糖蛋白CO6A6可作潜在的三阴性乳腺癌不同预后的生物标志物。