胞外酸中毒对未成熟树突状细胞蛋白质组学的影响

研究胞外酸中毒对未成熟树突状细胞(immature dendritic cells,imDCs)蛋白质组表达水平的影响,能够为深入研究酸性病理微环境调控imDCs免疫功能的分子机制奠定前期基础.体外诱导小鼠骨髓细胞分化为imDCs,pH6.5酸性条件处理imDCs 24 h,然后使用Label-free定量技术筛选出差异表达蛋白,结果显示,pH6.5处理使imDCs的389个蛋白表达发生显著变化.GO分析差异表达蛋白参与的细胞组分、分子功能及生物过程,KEGG分析差异表达蛋白涉及的信号通路,结果显示,这些差异表达蛋白参与核糖体形成、影响离子跨膜转运、细胞呼吸调节等过程,涉及的信号通路包括亨廷顿病信号通路、核苷酸结合寡聚化结构域(nucleotide-binding oligomerization domain,NOD)样受体信号通路以及环腺苷一磷酸(cyclic adenosine mono-phosphatec,cAMP)信号通路等.利用Cytoscape软件展示差异表达蛋白之间的互作网络图,并按照节点数筛选关键蛋白,筛选出下调关键差异表达蛋白核糖体蛋白(ribosomal protein,RP)S27A、核糖体蛋白S23(RPS23)、核糖体蛋白L21(RPL21)和CREB结合蛋白(CREB-binding protein,CREBBP)以及上调关键差异表达蛋白淀粉样前体蛋白(amyloid precursor protein,APP)和可溶性N-乙基马来酰亚胺敏感因子附着蛋白受体同源蛋白(soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor attachment protein receptors homolog,YKT6)等.