森林草莓SUN基因家族的鉴定及其对逆境的响应

Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology(2023)

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摘要
SUN基因是调控植物生长发育的关键基因.本研究鉴定了二倍体森林草莓(Fragaria vesca)的SUN基因家族,并对各成员的理化性质、基因结构、系统进化以及基因表达进行了分析.结果表明,森林草莓有31个FvSUN基因,其编码蛋白可聚类为7个组,同一组内成员具有高度相似的基因结构与编码蛋白保守域;FvSUNs蛋白的亚细胞定位主要在细胞核中.共线性分析表明森林草莓FvSUNs基因家族主要通过染色体片段复制产生,拟南芥与森林草莓存在23对直系同源基因.利用森林草莓的转录组数据,对FvSUNs基因的组织表达特征进行分析,发现主要可归为3类:各组织均表达、组织中几乎不表达、组织特异性表达,并通过实时荧光定量PCR(quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR)进一步验证结果.此外,还对森林草莓进行不同的逆境胁迫处理,qRT-PCR分析了 31个FvSUNs基因的表达情况,发现大部分基因均在不同程度上受低温、高盐或干旱胁迫的诱导表达.这些研究结果为深入揭示草莓SUN基因的生物学功能及其分子机制奠定了基础.
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关键词
Fragaria vesca,SUN gene family,expression pattern,sequence identification,stress-response
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