基于高通量测序分析黔中金荞麦内生菌及其根际土壤微生物多样性

为探究贵州药饲兼用牧草黔中金荞麦内生菌及其根际土壤微生物的群落组成与结构,本试验采用高通量测序技术对其测序并进行生物信息学分析.结果表明,内生细菌有效序列524889条,聚类注释得到OTUs 1675条;内生真菌有效序列569064条,注释得到OTUs 2076条.黔中金荞麦茎叶中内生细菌Chao 1指数、ACE指数、Simpson指数、Shannon指数均低于根部,而真菌的4个指数均高于根部.根际土壤微生物各指数均高于黔中金荞麦茎叶和根部,微生物种类最为复杂、数量最多.黔中金荞麦茎叶和根内生细菌群落以蓝藻菌门(Cyanobacteria)为优势菌门,相对丰度分别为75.23％和63.83％,根际土壤为变形菌门(Proteobacte-ria),相对丰度为36.12％;真菌门水平上,在茎叶、根及根际土中以子囊菌门(Ascomycota)和担子菌门(Basid-iomycota)为优势菌门.在属水平上,茎叶与根内生细菌中变形菌门未知属(unidentified_Chloroplast)相对丰度最高,分别占所有菌属的75.23％和63.82％,根际土壤中为赫黄嗜盐囊菌属(Haliangium),占所有菌属的2.96％;茎叶内生真菌枝孢菌属(Cladosporium)相对丰度最高(16.10％),根中灰球菌属(Bovista)相对丰度最高(17.67％),根际土壤中镰孢菌属(Fusarium)相对丰度最高(21.09％).综上,黔中金荞麦内生菌及土壤微生物群落多样性存在差异,为进一步对黔中金荞麦的资源保护和内生菌的开发利用提供了理论依据.