林麝肺成纤维细胞线粒体全基因组结构特征及遗传变异分析

TANG Kexin,WU Xi,FU Wenlong,CHENG Jianguo,WU Jie,ZHOU Lei,WANG Xiang,ZHAO Wei, REN Ziwei, LI Yimeng, LIU Jie,LUO Yan

wf(2023)

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摘要
林麝(Moschus berezovskii)是一种具有较高经济价值和药用价值的保护野生动物.为深入研究林麝线粒体基因组的结构特征及遗传变异,基于Illumina NovaSeq平台对林麝肺成纤维细胞FMD-C1线粒体进行全基因组测序,并进行特征注释、结构预测、序列分析和系统发育重建.结果显示,FMD-C1线粒体基因组序列全长为16 351 bp,共有13个蛋白编码基因(protein coding gene,PCG),22个tRNA,2个rRNA和两段非编码区,具有明显的AT偏好性.将序列上传至GenBank,登录号为MW879208.与NCBI上林麝的其余序列比对,FMD-C1的4个PCGs中检测出5个单氨基酸突变和3个插入氨基酸;D-loop区检测出19个差异碱基和2个碱基缺失.系统进化分析发现与林麝亲缘关系最近的是安徽麝.研究结果可为林麝的选育和遗传多样性保护提供参考依据,也为进一步探讨林麝肺部疾病线粒体水平的致病机制奠定基础.
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