大豆耐涝bZIP转录因子Glyma06g08390的生物信息学分析

bZIP转录因子在响应不同非生物胁迫中起着重要作用.本研究以耐涝性强大豆品种'齐黄34'作为材料,对其进行没顶淹水处理,取样进行转录组测序,筛选出1个差异表达的bZIP转录因子Gly-ma06g08390,并对其进行RT-qPCR检测,结果与转录组测序数据趋势一致,呈现上调表达.分析Gly-ma06g08390蛋白的保守结构域,发现该蛋白内部含有bZIP保守结构域.蛋白三级结构中存在与寡聚化作用的亮氨酸拉链区.预测与Glyma06g08390蛋白互作的蛋白,结果发现有两个蛋白是MAPK信号通路中的蛋白,分别MAPK2和MAPKK2.因此,我们推测Glyma06g08390可能与MAPK2和MAPKK2发生互作,激发了 MAPK信号通路来响应涝害胁迫.