中国柯萨奇病毒A组2型的遗传进化分析

目的 探讨中国柯萨奇病毒A组2 型(coxsackievirus A2,CV-A2)毒株的遗传进化特征.方法 收集中国CV-A2毒株的VP1区及全基因序列,采用MEGA 10.2.4软件构建系统进化树并开展氨基酸位点突变分析,采用SimPlot 3.5.1软件进行基因重组分析.结果 共收集到118条VP1序列和26条全基因序列.CV-A2毒株主要来源于广东省,毒株数量自2011年开始迅速增多.基于VP1序列构建的进化树有7个分支,原型毒株为独立A组,多数CV-A2毒株聚集于G组.具有全基因组序列的CV-A2代表株的基因重组分析显示毒株间存在基因重组.另外,VP1氨基酸序列共有22个突变位点.结论 中国流行的CV-A2毒株已发生较明显的基因重组和VP1区域氨基酸位点突变,监测CV-A2的演化对于手足口病的防控具有重要意义.