一株利福平高耐受鸭疫里默氏杆菌的分离鉴定及基因组分析

鸭疫里默氏杆菌(RA)为一种可引起鸭、鹅、鸡、火鸡等禽类急性或慢性败血症的革兰氏阴性菌,是鸭场重要病原菌之一.本研究利用鸭疫里默氏杆菌三重PCR鉴定方法,从养殖场病鸭的脏器中分离、鉴定出一株鸭疫里默氏杆菌,将其命名为RA-WH9;通过血清型鉴定实验和Kirby-Bauer药敏实验,确定了其血清型和药敏性;利用细菌基因组三代测序技术和生物信息学平台,我们构建并分析了RA-WH9基因组完成图.结果表明,RA-WH9为1型血清型鸭疫里默氏杆菌,对氨苄西林、多粘菌素B和利福平等抗生素耐药,其对利福平最小抑菌浓度达到50μg/mL.全基因组序列分析表明,RA-WH9染色体总长度为2488018 bp,GC含量34.58％,编码2563个基因,其中包含88个耐药基因,其耐药基因型与耐药表型一致.此外,RA-WH9携带一个全长10736 bp的质粒.本研究丰富了鸭疫里默氏杆菌的基因库,为鸭疫里默氏杆菌病的防控提供了依据.