2019-2020年西宁地区丙型肝炎病毒感染者基因序列分析

目的 了解2019-2020年西宁地区丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)感染者HCV感染株基因型.方法 采集2019-2020年青海省疾病预防控制中心门诊HCV感染者抗体阳性血清108份,采用实时荧光定量PCR法(RT-PCR)进行HCV-RNA阳性筛查,对HCV-RNA阳性标本进行RT-PCR特异性引物扩增后用直接测序法进行HCV基因片段的测序.结果 108份HCV抗体阳性血清标本中共检测到77份阳性血清,经过RT-PCR扩增,共检出54份阳性标本,测序后得到25份核苷酸片段,再经序列测序进化分析得到2a型17份,占总数的68％;1b型8份,占总数的32％.2a型分布于两个不同的分支上,其中一个分支与ZX 2005-197株(KP 721897.1)在同一分支上,此柱为有明显输血史感染柱,另一分支与广州GZ 0160(206047)和KM 26(KF 586099)WL 14(KF 586224.1)的自愿献血者感染株为同一分支;8份1b型分布于3个不同的分支,其中一组与上海的标准株PR 50(HQ 912957.1)在同一分支上,另一组与美国的毒株KY 565218.1亲源关系较近,其余的序列单独形成一个分支.结论 西宁地区HCV感染基因型以2a型为主,其次为1b型,此次检测结果与西宁地区其他关于HCV感染主要基因型研究报道有所不同.