山羊Wnt5A基因序列变异及其组织表达特征

羊绒的质量和产量决定着绒山羊(Capra hircus)的经济价值,而毛囊是调控羊绒生长和性状的直接组织,通过调控毛囊发育可实现羊绒性状的改良.无翅型鼠乳腺肿瘤病毒整合位点家族成员5A(wingless-type mouse mammary tumor virus integration site family member 5A,Wnt5A)基因是毛囊发育信号通路中的关键因子,在毛囊的发育过程中起着关键作用,但其在山羊中的研究还非常有限.为全面掌握山羊Wnt5A的分子遗传特征,本研究利用PCR-单链构象多态性(PCR-single strand conformation polymorphism,PCR-SSCP)结合测序,检测分析该基因在中卫山羊、柴达木绒山羊和陇东绒山羊群体中的变异特征;利用qPCR技术,分析Wnt5A在辽宁绒山羊和陇东绒山羊组织表达特征.结果显示:在陇东绒山羊、柴达木绒山羊和中卫山羊群体中,Wnt5A的exon 4扩增区存在2个突变位点,分别为c.334C>A和c.213A>G,形成A、B和C 3个等位基因并表现为AA、AB、AC、BB和BC 5种基因型.A和AB分别为柴达木绒山羊和陇东绒山羊中的优势等位基因和优势基因型,而中卫山羊中分别为B和BB.在该基因exon 6扩增区检测到由D和E 2个等位基因构成的DD、DE和EE 3种基因型,序列比对发现c.685-5C>T和c.685-55G>A 2个SNPs.3个群体中E均为优势等位基因,DE均为优势基因型.2个扩增区构成H1～H66种单倍型,其中频率最高的为H2.Wnt5A基因在辽宁绒山羊和陇东绒山羊的7种组织中均表达,品种间具有差异性,同时在皮肤中的表达差异显著,推测是由于Wnt5A基因的表达与羊绒性状相关造成的.该研究通过比较不同品种山羊Wnt5A基因的变异和表达特征,分析了该基因的分子遗传特征,为丰富山羊基因组内容及该基因的开发利用提供了基础资料.