珠海市HIV-1 CRF55_01B耐药及分子传播网络研究

目的 了解珠海市HIV-1新确证病例中CRF55_01B毒株的耐药及分子传播网络特征.方法 对2011-2020年珠海市新确证HIV-1 CRF55_01B毒株感染者的血浆样本提取RNA,扩增pol区基因序列并测序.运用美国斯坦福大学HIVdb数据库进行耐药突变分析,利用HyPhy 2.2.4以tn93模型计算序列间的两两基因距离,以1.5％作为阈值构建HIV分子传播网络,使用Cytoscape 3.7.0将网络可视化.结果 成功扩增获得66名CRF55_01B感染者的pol区基因序列.耐药性分析发现总耐药率为9.09％,其中NNRTI和NRTI的耐药率分别为6.06％(4/66)和3.03％(2/66),耐药水平均为低度耐药.NNRTIs相关的耐药性突变V179E和E138G检出率分别为96.97％(64/66)和6.06％(4/66),NRTIs相关的耐药性突变L210 W和K70 N检出率均为1.52％(1/66).通过构建传播网络,发现45.45％(30/66)的CRF55_01B参与构成9个传播簇,其中3个传播簇包括5例现住址为外市的流动病例.结论 珠海市HIV-1 CRF55_01B毒株耐药率较高,且本市居住人口和流动人口之间可能存在HIV的相互传播,建议加强和外省市开展联合HIV分子传播网络监测.