湖南省10株猪圆环病毒3型的测序与遗传进化分析

Progress in Veterinary Medicine(2022)

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摘要
为了解湖南省猪圆环病毒3型(PCV3)的遗传变异情况,以25份PCV3阳性样品DNA为模板,使用PCR方法分两段扩增PCV3全基因序列并进行拼接.结果获得7株PCV3分离株全基因组,3株PCV3 ORF2序列.7株PCV3全基因组的核苷酸序列同源性为98.8%~99.7%,10株ORF2的核苷酸序列同源性为97.8%~99.8%.根据系统发育树,PCV3可分为3个分支,所有分离株的遗传关系均较近.ORF2氨基酸序列突变少,发现2个在其他参考毒株中未出现的突变位点.研究获得的PCV3毒株序列与国内外PCV3毒株序列其遗传关系较近,无特殊突变,较为稳定.
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