高寒灌丛建群种高山绣线菊的低温适应转录组信息分析
Chinese Wild Plant Resources（2022）
摘要
利用高通量测序技术对高山绣线菊叶片进行转录组测序,获得的转录组数据可用来进行拼接、功能注释、表达水平及差异等分析.组装拼接后获得53892条Unigenes.与多个数据库进行比对后,31627条Unigenes成功注释到NR库;16166条基因注释到KOG数据库,共有26个子类;29111条注释到GO数据库,注释基因被分为分子功能、生物学过程和细胞组分3大类;3475条注释到KEGG数据库,涉及的代谢通路可归为四大类,分别是代谢相关通路、遗传信息处理、细胞过程及环境信息处理;此外,共统计到3条与低温胁迫代谢通路相关的主要途径,21条次生代谢途径,1168条Unigenes,涉及Unigenes数量最多的通路为碳代谢、氨基酸类的生物合成等.该研究旨在筛选高山绣线菊低温胁迫相关代谢通路,挖掘关键基因,对后续其适应低温胁迫分子机制的研究具有一定指导意义.
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