白蜡虫脂酰辅酶A还原酶基因家族鉴定及序列分析

LIU Wei, AN Jiaqi,GAO Xi,YANG Pu

Journal of Yunnan Agricultural University (Natural Science)(2022)

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摘要
目的对白蜡虫脂酰辅酶A还原酶 (fatty acyl-CoA reductase,far)基因家族进行鉴定和序列分析。方法以泌蜡昆虫白蜡虫作为材料,利用生物信息学分析方法对白蜡虫far基因家族进行鉴定。结果在白蜡虫基因组中共鉴定到30个far候选基因,其中22个FAR结构域包含完整的1个NAD(P)H 结合结构域和1个FAR C结构域。基序分析表明:多数白蜡虫FAR含有13个保守基序。白蜡虫far基因有6~11个外显子、5~10个内含子。白蜡虫FAR系统进化分析表明:白蜡虫FAR成员聚为2类。对不同物种FAR进行的系统进化分析表明:FAR聚类主要与物种亲缘关系有关,与功能的相关性不大。共线性分析与氨基酸相似性分析显示:亲缘关系相近的物种FAR相似性更高,一般同物种内FAR相似性最高。结论本研究有助于了解白蜡虫far基因家族的进化,为深入研究白蜡虫far基因家族参与不同的功能奠定基础。
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关键词
Chinese white wax scale insect,fatty acyl-CoA reductase,gene family,domain,phylogenetic analysis
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