基于WGCNA鉴定子宫颈鳞状细胞癌CD8+T细胞浸润相关的生物标志物

目的 应用生物信息学的方法构建促进子宫颈鳞状细胞癌(CSCC)中CD8+T细胞浸润的相关基因共表达网络,并鉴定出相应的预后生物标志物.方法 应用加权基因共表达网络分析(WGCNA)和PPI网络探索TCGA数据库中CSCC的基因表达数据,并筛选出与CD8+T细胞浸润相关hub基因,系统分析hub基因的免疫特征及预后价值.结果 通过WGCNA和PPI网络分析鉴定出10个hub基因(CCL5、CCR5、CD2、CD3D、CD3E、CD8A、CXCR3、IFNG、PDCD1、PRF1).在TISIDB数据库中查询10个基因与免疫细胞之间的相关性,发现这些基因的表达与免疫细胞,尤其是CD8+T细胞显著正相关.通过Kaplan-Meier分析、单因素和多因素Cox回归分析验证后选择CD3E作为CSCC预后生物标志物.基因集富集分析(GSEA)显示CD3E在细胞黏附分子、趋化因子信号通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用和T细胞受体信号通路显著富集.结论 通过生物信息学验证,CD3E被确定为CSCC免疫治疗的潜在生物标记物和免疫治疗靶点.