2018-2019年北京市西城区6起学校急性胃肠炎聚集性疫情的GⅠ诺如病毒病原鉴定与溯源研究

目的 分析2018-2019年北京市西城区6所学校发生的急性胃肠炎疫情GⅠ诺如病毒的基因型别特征.方法 收集2018-2019年西城区6所学校急性胃肠炎病例的粪便标本37份.采用实时荧光定量反转录聚合酶链式反应(real-time RT-PCR)对提取的G Ⅰ和GⅡ诺如病毒核酸进行检测.采用RT-PCR进行G Ⅰ诺如病毒聚合酶区和衣壳蛋白VP1区部分片段的扩增和测序.用诺如病毒在线分型工具对测序成功的毒株进行初步鉴定和基因分型,用BioEdit 7.0.9.0软件进行序列比对,用MEGA 6.06软件构建进化树.结果 6所学校(18,S1～S4和19,S5～S6)发生的诺如病毒急性胃肠炎疫情均为聚集性疫情,G Ⅰ诺如病毒核酸阳性率为83.78％(31/37),GⅡ诺如病毒未检出;聚合酶区和衣壳蛋白VP1区进化分析分别显示,1起疫情的4株诺如病毒毒株分别与G Ⅰ.Pd参考株和G Ⅰ.3b参考株在同一分支,5起疫情的19株诺如病毒毒株与G Ⅰ.Pb参考株和G Ⅰ.6a参考株在同一分支;每所学校毒株相似性为100.0％.双区分型合并结果,1起疫情由G Ⅰ.Pd-G Ⅰ.3b引起,该重组株与G Ⅰ.3[P13]/Hu/MT008455/2018/Shanghai/CHI 相似性高达 99.6％;5 起疫情由 G Ⅰ.Pb-G Ⅰ.6a 引起,这重组株与G Ⅰ.6[P11]/Hu/MZ227264/2016/US相似性高达98.1％.结论 2018-2019年北京市西城区6所学校诺如病毒急性胃肠炎聚集性疫情分别由G Ⅰ.Pd-G Ⅰ.3b和G Ⅰ.Pb-G Ⅰ.6a重组株引起.应加强对诺如病毒重组株分子流行病学监测,为诺如病毒疫情提供预警预测的依据.