独龙鸡卵巢转录组分析

为探索独龙鸡生产性状相关基因的调控关系,研究采集3只300日龄健康状况良好的独龙鸡卵巢组织作为试验样本,构建cDNA文库进行转录组测序,并与饲养条件和日龄相似的芦花鸡卵巢组织进行比较分析.结果显示:与芦花鸡相比,独龙鸡中平均含有416997个SNP位点,52458个可变剪接,共有2903个新基因,656个差异表达基因.GO分析显示差异表达基因主要涉及核糖体结构成分、细胞因子活性、结合等过程;KEGG分析显示差异表达基因主要富集在核糖体、氧化磷酸化、TGF-β、类固醇激素生物合成通路等;qRT-PCR数据显示10个差异表达基因的上下调趋势与转录组测序结果一致.研究结果表明候选基因细胞色素P450侧链裂解酶(CYP11A1)、细胞色素P450c17芳香化酶(CYP17A1)、细胞分裂周期蛋白26(CDC26)、分泌型卷曲相关蛋白4(SFRP4)可能是影响独龙鸡产蛋性能的重要候选基因,可进一步深入研究.研究结果为完善独龙鸡生产性状研究奠定了理论基础.