基于纳米孔测序技术对兔腹泻病原的鉴定
Animal Husbandry & Veterinary Medicine（2022）
摘要
为了探索纳米孔测序技术在动物传染病病原快速诊断中的应用价值,采集1只发生腹泻实验兔的肝脏和脾脏进行核酸提取、建库和纳米孔测序分析,同时对该腹泻的实验兔分别进行细菌分离鉴定和腹泻相关病毒的血清学检测.结果显示:纳米孔测序方法运行3h后,获得1.9GB的数据量,检出756 521条序列,平均序列长度为2 549.9个碱基.根据对测序数据的生物信息学分析表明,引起实验兔腹泻的病原可能为大肠杆菌.对同批送检的6只实验兔采用常规细菌分离鉴定方法在实验兔的心脏血样品、肝脏、肺脏和回盲部内容物中只分离到了大肠杆菌.对腹泻相关病毒的血清学检测结果显示6只送检的兔均为兔轮状病毒阴性.本研究采用纳米孔测序技术对发生腹泻的实验兔进行诊断,其结果与常规实验室检测方法获得的结果相符合,表明纳米孔技术在动物传染病病原快速检测中具有潜在的应用价值.
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