益生菌大肠埃希菌Nissle1917鞭毛蛋白的结构分析及表位预测

目的 分析益生菌大肠埃希菌Nissle 1917(EcN)鞭毛蛋白(FliC)的结构,并预测其B和T细胞表位.方法 从GenBank数据库中获取EcN FliC的氨基酸序列.应用ProtParam在线工具分析EcN FliC理化特性,Protscale在线工具分析亲疏水性,PSIPRED软件及DNAstar软件预测分析二级结构,I-TASSER在线软件预测三级结构,DNAstar在线工具中Protean软件和ABCpred软件综合预测B细胞抗原优势表位,细胞毒性T细胞(cytotoxic T cell,CTL)表位预测网站预测T细胞表位.结果 EcN FliC的相对分子质量为60 937.57,化学分子式为C2584H4201N745O940S6,不稳定指数为15.23;亲水性平均值为-0.324,为亲水性蛋白;α螺旋及无规则卷曲是EcN FliC二级结构中的主要结构;预测的三级结构模型具有正确的结构拓扑,可信度高;共筛选出13个B细胞优势表位及3个CTL优势表位.结论 EcN FliC特征分析及表位预测结果为其作为免疫佐剂的应用奠定了基础.