普通烟草热激转录因子家族的全基因组鉴定与分析
Chinese Tobacco Science（2022）
摘要
热激转录因子(heat shock transcription factor,Hsf)家族成员广泛参与植物生长发育和非生物胁迫的调控.本研究应用生物信息学和比较基因组学方法从普通烟草中鉴定了49个Hsf家族成员,发现这些Hsf家族成员均具有较为保守的寡聚化结构域.通过系统进化分析可将烟草和拟南芥的Hsf家族成员划分成3个分支与14个亚家族.共线性分析显示烟草Hsf基因与双子叶植物(拟南芥,番茄和葡萄)Hsf基因组成共线基因对的数量要大于与单子叶植物(水稻和玉米)Hsf基因组成共线基因对的数量.全基因组复制预测共有12个NtHsf基因可组成7条复制基因对.启动子分析发现NtHsf基因启动子区域存在着多个与非生物胁迫相关的顺式作用元件.表达模式分析证实NtHsf家族成员在不同组织的表达具有差异,并且大多数NtHsf家族成员可响应热和干旱胁迫.研究结果可为烟草Hsf转录因子家族成员的功能研究奠定生物信息学基础.
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