A importância da preparação de estruturas na metodologia de docking molecular

As etapas de preparação do docking molecular são de extrema importância para obtenção de resultados fidedignos. Esta metodologia pode ser empregada de diversas maneiras, sendo uma delas a triagem virtual de substâncias que tem como finalidade filtrar grandes bibliotecas de compostos. Assim, o ajuste correto de parâmetros, como o provável estado de protonação dos grupamentos funcionais das moléculas, têm impacto na fidelidade do resultado das simulações de {docking. Neste artigo, serão apresentados os parâmetros de docking para a preparação do sistema. E também a comparação entre um sistema que obedece aos parâmetros de preparação e outro sem ajustes, com a finalidade de esclarecer a influência de cada etapa.