玉米ACO家族的全基因组鉴定与表达分析

Journal of Natural Science of Hunan Normal University(2022)

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摘要
为培育玉米抗虫品种,采用生物信息学的方法对玉米ACO基因家族进行成员鉴定和分析.结果表明:玉米ACO基因家族成员有8个,等电点4.97~5.49.ACO基因分布在第2,4,5,7及10号染色体上.二级结构显示,该家族蛋白结构主要以α-螺旋、β-折叠和不规则卷曲为主.根据氨基酸序列相似性,玉米、拟南芥和水稻中的ACO蛋白可分为3个亚族:ACOⅠ~ACOⅢ,同族成员基因结构分布及氨基酸序列有很高的相似度.基因保守基序分布显示,ZmACOs蛋白均含有motif6-motif4-motif2-motif1-motif8分布的5段保守基序.基因启动子作用元件分析显示,玉米ACO基因启动子元件类型可分为激素应答元件和胁迫应答元件两大类.受粘虫取食后,除ZmACO2外,其它玉米ACO家族基因表达量均升高,其中ZmACO6和ZmACO7在取食前后表达量差异最明显,推测其参与了玉米的抗虫响应.
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