小麦miRNA启动子的基因组分析

MicroRNA(miRNA)是一类非编码RNA,与植物的生长发育及胁迫响应密切相关.为给小麦miRNA的转录调控以及新miRNA的预测提供参考依据,本研究通过小麦miRNA基因定位、启动子预测以及顺式作用元件鉴定等方法对小麦miRNA启动子进行了基因组分析,结果表明,小麦基因组中有105个pre-miRNA位于150个基因座上,大部分为单拷贝.148个miRNA基因座具有潜在启动子区域,其中115个miRNA基因至少能够预测到一个启动子.保守性及基因位置不同的miRNA的启动子转录起始位点(TSS)分布也稍有不同,但大多数位于上游序列近端区域.对miRNA基因TSS上游序列的顺式作用元件分析发现,miRNA启动子区域存在与胁迫响应相关的基序,且小麦中存在3个miRNA启动子特异性基序.61.4％的小麦miRNA启动子区域有CpG岛分布.