一个新的丹参CYP450的克隆和生物信息学分析

从丹参(Salvia mihiorrhiza Bunge)中克隆1个新细胞色素P450基因SmCYP71D411.1,采用生物信息学的方法,对该基因进行序列特征和组织表达特性分析.提取丹参根部总RNA后反转录为cDNA,克隆得到SmCYP71D411.1基因全长,构建克隆重组质粒.利用生物信息分析预测蛋白质性质、结构.并利用实时荧光定量PCR进行了组织表达特异性分析.SmCYP71D411.1 cDNA全长1 539 bp,编码498个氨基酸,相对分子质量56 541.42 Da,理论等电点7.67.亚细胞定位于叶绿体类囊体膜、细胞质、叶绿体基质等.Sm-CYP71D411.1在根周皮中的表达量最高.本研究克隆得到一个新基因SmCYP71D411.1,并进行了生物信息学分析,为进一步验证该基因的功能提供了一定的基础.