茶树树型相关CYC/TB1家族全基因组鉴定及表达分析

XU Wenluan, ZHONG Hanjiang, LIU Xingyue, WU Jiayi, YAN Anran,ZHAO Peiling,ZHANG Xuyang,ZHANG Qunfeng,NI Dejiang,WANG Mingle

Plant Physiology Communications(2021)

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摘要
TCP (TEOSINTE BRANCHED 1/CYCLOIDEA/PROLIFERATING CELL FACTOR)是植物所特有的一类转录因子,广泛参与调控植物的生长发育.本研究从茶树基因组中获得茶树TCP家族CYC/TB1亚类分支的4个成员,分别命名为CsTCP1、CsTCP8、CsTCP12和CsTCP18.保守结构域分析发现,它们均包含典型的TCP结构域.亚细胞定位预测表明,其编码蛋白均定位于细胞核.系统进化分析可将CYC/TB1亚类分为四个分支(CYC1、CYC2、CYC3和TB1),其中CsTCP1和CsTCP18同属于CYC1支,CsTCP8属于CYC2支,CsTCP12属于CYC3支.qRT-PCR分析发现,这四个基因在不同茶树树型不同部位中存在组织特异性表达:CsTCP1在成熟叶中表达量最高;CsTCP8主要在腋芽和嫩茎中表达;CsTCP12的表达量较低,在多个品种中未检出;而Cs TCP18在6个茶树品种的各部位均有表达,但有一定差异,推测该亚族基因可能参与茶树的腋芽生长并调控茶树分枝.进一步对缺氮条件下这四个基因的表达量分析发现,CsTCP1在新梢中的表达量逐渐降低;CsTCP8的表达先升高后降低;CsTCP18的表达趋势与CsTCP8相反,表达量在缺氮12 h时达到最高;而Cs TCP12的表达量较低,在缺氮条件下未被检出,推测该亚族基因可能参与缺氮响应.
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