广东省2018年手足口病病原谱及柯萨奇病毒A10型基因特征分析

Chinese Journal of Virology(2020)

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摘要
广东省手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)监测数据显示,2018年5~7月非肠道病毒A组71型(Enterovirus A71,EV-A71)、非柯萨奇病毒A16型(Coxsackievirus A16,CV-A16)和非柯萨奇病毒A6型(Coxsackievirus A6,CV-A6))的其他肠道病毒(以下简称"其他EV")阳性率大幅度增高,经鉴定60%为柯萨奇病毒A10型(Coxsackievirus A10,CV-A10).因此,为了解广东省2018年HFMD病原谱及CV-A10的基因特征,本研究收集2018年哨点监测数据进行统计分析,采集HFMD其他EV标本进行分型鉴定,并随机选取2008~2018年CV-A10阳性标本开展VP1全长序列测序与分析.结果显示,广东省2018年HFMD病原谱包括24种肠道病毒,阳性率位于前三位的分别是CV-A16(30.73%)、CV-A6(24.29%)和CV-A10(≈11.0%).CV-A10主要流行于5~7月份,且在各市广泛流行,所致HFMD重症率低于EV-A71,却高于CV-A16和CV-A6.遗传进化分析发现,CV-A10可分为A、B、C、D、E、F、G7个基因型,C基因型包括C0、C1和C2 3个亚型.广东省211株CV-A10中,2株为B基因型,2株为C1亚型,207株为C2亚型.207株C2亚型包括3个基因群,其中C2a基因群16株,流行于2008~2012年;C2b基因群36株,流行于2010~2014年和2016年;C2c基因群155株,流行于2011 ~ 2018年.根据以上结果表明,广东省2018年HFMD病原以柯萨奇A组肠道病毒为主,其中CV-A10是引起5~7月份手足口病暴发优势病原之一.基于VP1基因分析,CV-A10可分为A、B、C、D、E、F和G等7个基因型.广东省存在B和C基因型,其中C基因型的C2c基因群是优势流行株.
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