基于生物信息学分析prohibitin在肾透明细胞癌中的表达及意义

目的 通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析prohibitin(PHB)在肾透明细胞癌中的表达及与患者临床特征和预后的关系,为研究肾透明细胞癌的发病机制及治疗方法提供新思路.方法 通过TCGA、人类蛋白质图谱(HPA)数据库检索PHB基因在人体正常组织中的表达情况,通过UALCAN数据库分析PHB基因在肾透明细胞癌组织与正常肾组织中的表达水平,并分析PHB表达水平与肾透明细胞癌患者临床特征和预后的关系,利用String数据库预测与PHB基因相互作用的蛋白,并进行基因本位(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析.结果 PHB基因在肾透明细胞癌组织中的相对表达量明显低于正常肾脏组织(P﹤0.01).男性、未分化肾透明细胞癌患者肿瘤组织PHB基因相对表达量分别低于女性、低中高分化患者(P﹤0.05).PHB低表达肾透明细胞癌患者总生存期短于PHB高表达患者(P﹤0.05).将交集靶点导入String数据库,得到蛋白质互作网络,共筛选出20个与PHB基因相互作用的蛋白.GO分析结果显示,细胞成分主要集中于细胞内液、细胞质、细胞质膜及线粒体等,生物进程主要集中于细胞内信号转导、细胞死亡调控及细胞凋亡调控等,分子功能主要集中于蛋白结合、ATP结合、蛋白酶激活等;KEGG通路富集分析主要富集于磷脂酰肌醇-3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(AKT)信号通路、免疫反应相关通路等.结论 PHB在肾透明细胞癌组织中低表达,PHB表达水平可作为肾透明细胞癌患者诊断、治疗及预后评估的潜在分子标志物.