GeneXpert MTB/RIF 阳性 RNA 聚合酶β亚基基因突变的结核病患者中利福平耐药决定区突变特征研究

目的:通过分析GeneXpert MTB/RIF(简称"Xpert")阳性RNA聚合酶β亚基(rpoB)基因突变的结核病患者中rpoB基因探针的突变分布与频率,阐述利福平耐药决定区的突变特征.方法:连续纳入2019年6月至2020年6月就诊于首都医科大学附属北京胸科医院的Xpert检测阳性且rpoB基因突变的682例结核病患者,其中肺结核618例,肺外结核64例.收集患者临床检测标本,其中痰液465份,支气管肺泡灌洗液153份,脓液37份,胸腔积液19份,便标本7份,脑脊液1份.分析所有Xpert阳性标本中结核分枝杆菌(MTB)的半定量结果及rpoB基因探针的突变分布情况.结果:682份标本中,MTB含量半定量水平为高占6.45％(44/682),中占25.07％(171/682),低占25.51％(174/682),极低占42.96％(293/682).肺外结核标本中MTB含量半定量极低水平高于肺结核标本[分别为64.06％(41/64)和40.78％(252/618)],差异有统计学意义(x2=12.83,P＜0.001).标本涂阳率在MTB含量半定量水平为高、中、低和极低水平的标本中分别为84.62％(33/39),64.02％(105/164),27.27％(42/154)和7.84％(20/255).rpoB 基因单探针突变率为92.82％(633/682),双探针突变率为6.89％(47/682),三探针突变率为0.29％(2/682).单探针突变的标本中,突变率最高的为探针E(74.34％,507/682),其次为探针D(8.80％,60/682);双探针突变的标本中,突变率最高的为探针D+E(4.25％,29/682),其次为探针A+B(1.76％,12/682);2例三探针突变均为探针A+D+E.结论:Xpert阳性rpoB基因突变MTB中以单探针突变为主,在肺结核和肺外结核中最常见的突变探针均为探针E和探针D.