参薯miR156和靶基因SPL特征分析

参薯(Dioscorea alata)在热带和亚热带广泛种植,为该地区的人提供了粮食,具有重要的经济价值.miR156及其靶基因SPL对植物的生长发育的调控起到重要的作用,为了分析参薯中miR156-SPL的调控模块,本研究对参薯miR156基因位点和对应靶基因进行预测和验证.基于参薯基因组以及转录组信息,一共得到DamiR156的8个基因位点,预测了miR156的6个靶基因,其中4个属于SPL基因家族.多序列比对分析发现8个Da-miR156的前体序列在发卡区高度保守,根据序列同源性可以分为3组.表达谱数据和RT-qPCR表明DamiR156在参薯组培再生植株的叶、茎、块茎各个组织表达量远高于田间参薯,且在块茎中表达量也高于其他组织,初步推断Da-miR156在薯块发育的过程中发挥作用.5'-RLM-RACE实验验证了DaSPL被miR156切割的位点,为开展参薯SPL基因功能分析提供了参考依据.本研究通过对参薯miR156和靶基因SPL特征研究为分析miR156-SPL调控模块在参薯薯块发育中的作用打下科学基础.