A型塞尼卡病毒与O型、A型、亚洲I型口蹄疫病毒多重TaqMan荧光定量RT-PCR检测方法的建立及应用

为建立鉴别检测A型塞尼卡病毒(SVA)与O型、A型、亚洲I型口蹄疫病毒(FMDV)的方法,针对SVA 3D基因与O型、A型、亚洲I型FMDV VP1基因,分别设计特异性引物和TaqMan探针,经优化反应条件,建立了同时检测SVA与O型、A型、亚洲I型FMDV的TaqMan荧光定量RT-PCR方法.所建立的方法能特异性扩增SVA及O型、A型、亚洲I型FMDV,与其他主要猪源病毒无交叉反应;对SVA与O型、A型、亚洲I型FMDV质粒标准品的检出下限分别为2.50×101、2.50×102、2.50×102、2.50×102 copies/μL;组内与组间重复性试验的变异系数均小于2％.应用所建立方法检测2019年来自广西省的30份临床疑似样品,SVA和O型FMDV的检出阳性率分别为20％和70％,而未能检出A型和亚洲I型FMDV.结果表明,本研究所建立的多重荧光定量RT-PCR方法为SVA与O型、A型、亚洲I型FMDV的临床检测和流行病学调查提供了特异、敏感、高效的技术手段.