猪圆环病毒2型湖南株的分离鉴定与进化分析

Chinese Veterinary Science(2020)

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摘要
为了解湖南某规模猪场引起繁殖障碍主要病原的感染情况,本研究通过荧光定量PCR检测了血液样品中的6种病原,发现存在PCV2感染.对阳性样品进行全基因组扩增、克隆和测序后,与国内外其他PCV毒株进行同源性比对,绘制系统遗传进化树,并通过猪肾细胞系对病毒进行分离培养及免疫荧光鉴定.结果显示,样品中分离的2株毒株均为PCV2d型,基因组全长均为1 767 bp,其核苷酸同源性为99.7%,四处差异均位于ORF2区,其中命名为NX-P3-1毒株的第97位精氨酸突变为甘氨酸,位于衣壳蛋白T细胞表位区;与其他毒株相比,与海南HN1407株同源性最高,分别为99.7%和99.6%,遗传亲缘关系较为接近;PCV2d型毒株之间的差异主要位于B细胞表位区;免疫荧光鉴定显示NX-P3-1毒株可稳定感染和增殖.本研究为分析湖南PCV2流行情况提供了参考依据.
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