氮胁迫下小麦叶片转录组分析
Journal of Agricultural Science and Technology（2020）
摘要
氮素是小麦生长发育过程中重要的营养元素,利用转录组技术鉴定参与小麦低氮胁迫分子调控网络的基因,对揭示小麦耐低氮分子机理、开展耐低氮育种具有重要参考意义.采用Illumina HiseqTM 2500高通量测序技术,对小麦品种晋麦47正常生长和低氮胁迫下的叶片进行转录组测序,筛选差异表达基因并在GO、KEGG数据库中进行比对注释,分析小麦低氮胁迫响应相关基因.结果 显示,对照组与低氮组分别获得高质量序列52 383 726和52 192 061条,检测到差异表达基因1 267个,其中上调表达基因179个,下调表达基因1 088个.差异基因GO功能注释到3个大类的44个功能组.差异表达基因被注释到178个途径上,主要富集于氨基酸代谢、碳水化合物代谢、脂类代谢和信号传导等途径.转录因子分析发现,在低氮条件下变化明显的转录因子家族包括WRKY、MYB和NAC等.
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