兔出血症病毒2型TaqMan探针荧光定量RT-PCR检测方法的建立及应用

Jiangsu Journal of Agricultural Sciences(2021)

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摘要
以新发生的兔出血症病毒2型(RHDV2)SC2020/04株VP60基因序列为参考,设计出1对特异性引物和TaqMan探针,建立了一种快速、灵敏且特异的用于检测新型病毒的荧光定量RT-PCR检测方法.试验结果显示:本研究建立的方法,标准曲线线性关系良好,R2值达到0.999;其特异性较好,与兔出血症病毒1型(RHDV1)、仙台病毒(SV)和轮状病毒(RRV)病原均无交叉反应;灵敏性高,最低检出量为1μl 1×10拷贝;且重复性良好,批内和批间试验的变异系数平均值均小于2%.临床检测结果表明,利用该方法对108份临床病料进行检测,检出RHDV2阳性样品72份,检出率为66.7%,明显高于常规的RT-PCR方法(62.0%).结果证明,新建立的TaqMan荧光定量RT-PCR方法适合于RHDV2感染的特异性诊断.
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