陆地棉GELP家族基因鉴定及其响应胁迫的表达分析

MO Shaojing,WANG Zhicheng,WANG Xingfen,LIU Zhengwen,WU Liqiang,ZHANG Guiyin,MA Zhiying, ZHANG Yan,DUAN Huijun

Journal of Agricultural Science and Technology（2022）

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摘要

GELP型脂肪酶(GDSL-type esterase/lipase proteins,GELPs)是一类N端含有GDSL-motif的脂质水解酶,在植物生长发育、应激反应及病原菌防御中均发挥非常重要的作用.基于最新发布的陆地棉基因组数据,从全基因组水平上鉴定出210个陆地棉GELP基因,根据系统发育关系将其分为10个亚家族(A～J).这些GhGELP基因不均匀地分布在26条染色体上,且主要分布在染色体两端.基因结构分析表明,高达66.7％的GhGELP基因被4个内含子打断,其编码区域由5个外显子组成.分析发现,GhGELP基因启动子区域共存在7种激素和逆境胁迫响应元件.最后,利用RNA-seq数据研究了GhGELP基因在黄萎病菌和多种非生物胁迫处理下的表达谱.表达分析显示,大多数GhGELP基因响应黄萎病菌诱导后表达量下调,受非生物胁迫诱导后亦呈下调表达趋势,且一些成员可同时响应多种非生物胁迫.对棉花GELP基因家族进行了鉴定和分析,为后续研究其功能提供了一定的理论依据.

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