基于网络药理学与分子对接探讨连花清瘟胶囊入血成分干预细胞因子风暴防治新型冠状病毒肺炎的作用机制

Natural Product Research and Development(2021)

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摘要
利用网络药理学与分子对接从细胞因子风暴角度分析连花清瘟胶囊入血成分干预新型冠状病毒肺炎(COV-ID-19)的可能作用机制.通过文献挖掘确定连花清瘟胶囊入血成分,借助TCMSP和BATMAN-TCM数据库检索连花清瘟胶囊人血成分相关作用靶点;利用GeneCards、OMIM和Drugbank数据库筛选COVID-19与细胞因子风暴相关靶点;通过String数据库构建蛋白互作PPI网络;应用DAVID数据库进行GO分析和KEGG通路分析;使用Cytoscape 3.8.0软件构建网络图;通过AutoDock软件进行分子对接;此外,检索多器官组织损伤、免疫损伤和SARS相关靶点,并与细胞因子风暴取交集.共收集17个连花清瘟胶囊人血成分,获得相应靶点237个,与疾病相交集靶点得到47个,筛选出22个核心靶点;GO分析和KEGG通路分析分别获得174个和83个条目(P<0.01);分子对接结果显示Emodin、Formononetin、Rutin、Gallic acid、Liquiritigenin核心化合物与AKT1、IL-6、TP53、JUN、TNF核心靶点有良好的结合能力;连花清瘟胶囊入血成分与多器官组织损伤及免疫损伤相交集靶点比例1.6% ~2.0%,与SARS交集靶点比例4.3%.连花清瘟胶囊入血成分干预细胞因子风暴防治COVID-19通过多成分、多靶点、多通路协同发挥作用,其作用机制可能与清除抗原、调节免疫和保护组织器官有关.
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