2012-2019年北京市朝阳区霍乱弧菌毒力基因和PFGE分子分型特征分析

China Preventive Medicine(2021)

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摘要
目的 了解2012-2019年北京市朝阳区霍乱弧菌毒力基因和脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel elee-trophoresis,PFGE)分子分型特征.方法 收集2012-2019年北京市朝阳区分离的可疑O1群和O139群霍乱弧菌菌株,常规方法鉴定后,用实时荧光定量PCR (real-time PCR)对菌株进行分子水平鉴定并检测霍乱弧菌ctxAB基因;用PCR方法检测toxR、hlyA-El、hlyA-Cl、ompU、tcpA-El、tcpA-Cl、tcpI、rtxC、zot和ace 10种毒力基因.用Not Ⅰ和SfiⅠ两种内切酶对菌株进行PFGE分子分型试验,用BioN-umerics (Version 5.01,Applied Maths,Inc)软件处理和读取PFGE图像,进行菌株图谱相似度聚类分析.结果 共分离到37株霍乱弧菌,O1小川型/产毒株、O1小川型/非产毒株、O1稻叶型/非产毒株和O139/产毒株构成比分别为2.70% (1/37)、67.57% (25/37)、27.03% (10/37)和2.70% (1/37).所有菌株toxR、hlyA-El、hlyA-Cl和rtxC基因携带率为100.00%,其他毒力基因ompU、tcpA-El、tcpA-Cl、tcpI、zot、ace和ctxAB的携带率分别为56.76% (21/37)、45.95% (17/37)、43.24% (16/37)、54.05% (20/37)、24.32% (9/37)、24.32% (9/37)和5.41% (2/37);37株霍乱弧菌的11种毒力基因分为携带谱P1~P22,携带毒力基因为4~10种,携带5种毒力基因的P3占优势(构成比为21.62%,8/37).26株O1群小川型PFGE图谱相似度为62.90%~100.00%,型别为CYXC01~CYXC20;10株O1稻叶型PFGE图谱相似度为67.90%~100.00%,型别为CYDY01~CYDY09.36株O1群霍乱弧菌的21种毒力基因携带谱与29个PFGE型别相互对应分散.结论 2012-2019年北京市朝阳区霍乱弧菌以O1小川型/非产毒株为主,毒力基因携带谱和PFGE型别多样,同种毒力基因携带谱与同一PFGE型别相互对应不完全一致.
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