哈萨克绵羊DRB1基因外显子1和4多态性与布鲁氏菌病的相关性研究

China Animal Husbandry & Veterinary Medicine(2020)

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摘要
试验旨在对哈萨克绵羊DRB1基因外显子1和4多态性与布鲁氏菌病的相关性进行研究.使用虎红平板凝集试验(RBPT)对试羊的血清进行血清学检测,参考GenBank中绵羊MHC Class Ⅱ区DRB1基因序列(登录号:NC_040271.1),对其外显子1和4片段设计引物,采用PCR-SSCP和DNA测序技术对230只哈萨克绵羊的DRB1基因进行多态性检测,分析其多态位点与哈萨克绵羊布鲁氏菌易感性之间的关系.RBPT检测发现66只哈萨克绵羊为布鲁氏菌感染阳性,阳性检出率为28.7%.外显子1片段存在一个SNP位点(F1-G22A),测序确定两种基因型(GG、GA),优势等位基因和基因型分别为G、GG,F1-G22A多态位点的易感基因型为GA.卡方检验表明,哈萨克绵羊DRB1基因F1-G22A多态位点与布鲁氏菌易感性的相关性不显著(P>0.05).通过生物信息学在线软件分析得出,F1-G22A多态位点导致了RNA二级结构的改变和最小自由能的降低,引起了蛋白质二级结构的改变.DRB1基因外显子4片段未发现SNPs.由此得出,哈萨克绵羊DRB1基因F1-G22A多态位点与布鲁氏菌易感性可能存在一定的相关性.
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