Análisis filogenético y de presión evolutiva de secuencias nucleotídicas del gen VP4 de especies de enterovirus humanos

El genero Enterovirus es un grupo viral que afecta a un amplio rango de hospederos, entre ellos los humanos (especies A, B, C, y D), causan enfermedades respiratorias, gastrointestinales, neurologicas, y otras, y son altamente contagiosos. Los sintomas pueden ser leves o graves. El objetivo del trabajo fue analizar la variacion nucleotidica, filogenetica y de presion evolutiva de secuencias nucleotidicas del gen VP4 de las cuatro especies que afectan a los humanos. Se emplearon 92 secuencias nucleotidicas disponibles en la base de datos GenBank; estas se editaron con el software BioEdit y se alinearon con Clustal W; las relaciones filogeneticas se determinaron con MEGA6, y las presiones evolutivas con los algoritmos SNAP y SLAC. Se encontro que la identidad nucleotidica minima intra-especie fue de 43,2% (especie B) a 72,6% (especie D). Los genotipos mas variables por especie fueron EV-71 (A), Echovirus 2 (B), EV-118 (C), y EV-94 (D). El analisis de presion evolutiva mostro que el gen VP4 en las cuatro especies evoluciona bajo presion selectiva negativa. Esto indicaria que la alta tasa mutacional y eventos de recombinacion no tienen un rol significativo en la evolucion de este gen, debido probablemente a la localizacion interna de la proteina VP4.