百合属5种植物的比较转录组分析

百合属植物是多年生的宿根草本植物,具有重要的观赏价值,有的种可食用也可药用.本研究对百合属4种植物(细叶百合、川百合、卷丹和百合)花的转录组进行测序,并结合前期的野百合的转录组数据进行比较转录组分析,鉴别花发育相关基因.并筛选出5种植物的直系同源基因,进而检测正选择基因,分析它们对环境的适应性.通过组装分别在细叶百合、川百合、卷丹以及百合花中获得了44565、51413、41638和44716个unigene.为了了解unigene功能信息,将其在公共数据库中进行比对和注释,发现了13个花发育相关基因.另外,在5个物种间共获得8247对直系同源基因,并计算其Ka、Ks及Ka/Ks值.在5个物种中有33对直系同源基因受到了强烈的正选择作用,随后对其进行GO、KEGG功能富集分析及基因功能注释,发现这些基因主要是与抗性以及生物合成相关的基因.