植物基因组组装技术研究进展

Biotechnology Bulletin(2021)

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摘要
获得包含基因组全序列的参考基因组是对物种进行基因组学研究和利用的前提.大多数被子植物经历过全基因组复制或多倍化以及随后的染色体重排、丢失,很多植物还经历过重复序列大规模扩张,导致了基因组大小的剧烈膨胀,这些事件塑造了植物基因组复杂的特征和广泛的多样性,也在一定程度上导致了植物基因组组装的诸多难题.本文将植物基因组按照简单、高杂合、高重复、高倍性基因组和泛基因组进行分类,介绍不同类型的基因组适用的组装策略及应用效果,并对新测序技术在组装中的应用趋势进行展望.
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关键词
genome,assembly,plant
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