不同宿主源柯克病毒的HP4基因特征及遗传进化分析

为了解新疆地区柯克病毒(kirkovirus)宿主范围及其遗传多样性,本研究采集新疆阿拉山口市、和田市、昌吉市、哈密市和阿勒泰地区130匹纯血马、547峰骆驼、217头新生仔猪、73头驴、76只羊和86头牛共计1129份肛拭子样品.利用kirkovirus假定蛋白4基因(Hypothetical protein 4,HP4)通用引物,对样品进行PCR检测.结果显示马、猪、驴、羊和牛肛拭子样品的病毒阳性率分别为26.9％(35/130)、65.4％(142/217)、27.4％(20/73)、65.8％(50/76)和30.2％(26/86),表明kirkovirus在不同宿主广泛分布.其中,新生仔猪腹泻样品的病毒阳性率为100％(141/141),而新生健康仔猪样品中的阳性率为1.3％(1/76),提示该病毒感染可能与新生仔猪腹泻有关.马、驴、牛、羊和猪源kirkovirus之间HP4基因核苷酸和氨基酸序列同源性分别为81.4％～100％、62.8％～100％,表明kirkovirus HP4基因具有遗传变异多样性.猪源kirkovirus Porcine-34株与其他27株kirkovirus HP4的核苷酸和氨基酸序列的同源性最低,分别为81.4％～88.1％、62.8％～72.1％,其中有43个碱基位点是其特有的,对应33个氨基酸位点的突变.另外,HP4氨基酸序列遗传进化分析显示猪源kirkovirus Porcine-34株在进化树中形成一个独立进化分支,远离其余27株猪、马、牛、羊和驴源kirkovirus形成的另一进化分支,上述结果表明猪源kirkovirus Porcine-34株可能是新的病毒亚型.本研究首次鉴定了新疆地区不同宿主源kirkovirus并对其HP4基因进行遗传进化分析,发现该病毒在不同宿主广泛分布,为kirkovirus的流行病学研究提供了参考依据.